בתקופה זו, כששוב עולים וגואים גלי אנטישמיות ברחבי העולם,  ויש המכחישים את השואה, מוטלת עלינו האחריות החינוכית להנחיל לילדינו  בכל דרך שהיא את מאורעות התקופה ,מתוך הזעקה "לזכור ולעולם לא לשכוח" ! שכן, אנו מאמינים ולאור זאת מחנכים את ילדינו,  שאדם, שאינו יודע ומכיר את עברו, לעולם לא יוכל לבנות את עתידו. הרעיון להקמת המיני מוזיאון הוא , אם כן, הרצון לעבות את העשייה הלימודית הנרחבת  המתקיימת זה מספר שנים בבית ספרינו בנושא מורשת, ומתוך חשיבה של" דור לדור יביע אומר".במסגרת תוכנית הלימודים, שפותחה בבית ספרינו, נחשפים התלמידים לפרקים בתולדות העם היהודי- תוך הדגשים שונים בכל שנה ובכל שכבה.

השואה והגבורה הינם פרק חשוב וקשה בתולדותינו, ויש ללמדו בכתות השונות מתוך גישה עניינית, ובהתאמה לגיל התלמידים. תקופת השואה רחוקה בשנים מתלמידינו הצעירים  ותפקיד המוזיאון הוא להעביר את הילד במנהרת הזמן, חוויה חושית.  המבקר במוזיאון יעבור את כברת הדרך  על אבנים משולבות, המזכירות את הדרכים באירופה, בדרכו אל  איזור מחנות הריכוז וההשמדה ידרוך על אבני חצץ ויצעד על קטע של מסילת ברזל. הליכה קצרה זו תמחיש את דרכו של הילד היהודי  בתקופת השואה מתוך חוויה רגשית ומוחשית  של מאורעות התקופה. התמונות והמוצגים במוזיאון נבחרו בקפידה, ובאים להמחיש את תחושת ההשפלה והרדיפה של היהודים באותם ימים. המוצגים לא באים לזעזע את המתבונן, אך מעידים על התקופה. לאורך כל  המסע במוזיאון, מלווה אותנו "הילד הכחול", דמות חסרת פנים, המייצגת  את    הילדים שעברו את השואה. בוגרי מחזור ע"ב, נטעו 6 עצי זית לזכרם של ששת המיליונים.  החורשה הוקדשה לחסידי אומות העולם, ולזכרו של "פיוטר בודניק", חסיד אומות עולם, שהינו סבם ואביהם של תלמידים  מבית-הספר, ומשפחתו היא חלק מהקהילה.

"מרכז הלמידה" – אל מרכז הלמידה נכנסים התלמידים על מנת להעמיק את למידתם בנושאים הנלמדים בכתות.  "מרכז הלמידה"  בנוי מפינות למידה, כשבכל פינה ילמד התלמיד בעזרת עזרים שונים על הנושא והתקופה המאופיינים לו. המרכז בנוי על-פי רצף זמנים הסטורי, הוא מתחיל בחזונו של הרצל ומסתיים בחזון בתפארתו. המרכז משלב בתוכו אמצעי למידה מגוונים: ספרים, כרטיסיות מידע  לצד עזרים טכנולוגיים, סרטי וידאו,  קלטות שמע ומחשבים.